一般而言，從效率角度出發，
碳交易體系更適合于大的排放主體，而小的排放主體更適合采取碳稅的方式進行規制。因此針對不同行業、不同排放源、不同規模的主體適用不同的
政策，可以確保碳定價機制覆蓋到所有的排放主體，同時又避免造成同一主體的負擔過重。
在歐洲，歐盟排放交易體系（EU ETS）覆蓋了
電力部門和大工業部門，而碳稅則覆蓋了來自汽車燃料、居民部門和小工業部門等非ETS排放部門——這些部門貢獻了歐洲55%的二氧化
碳排放量。所以，新開征碳稅的歐盟國家，一般將受EUETS規制的主體排除在碳稅的范圍之外。如法國2014年開征的碳稅主要針對天然氣、石油和煤炭等化石燃料征收，它與EU ETS并行存在，沒有交叉；葡萄牙2015年開征的碳稅同樣僅適用于非EU ETS部門使用的能源產品。那些在EU ETS實施之前已經征收碳稅的國家，一般也在EU ETS實施后修改稅法，免除EUETS覆蓋主體的碳稅義務，如冰島、瑞典、丹麥等國。
當然，碳稅和碳交易并非不可同時覆蓋同一部門，為了更好實現
減排目標，對一些高排放部門，一些國家在將其覆蓋進碳交易體系的同時也對其保持征收碳稅，其中較為典型的國家是挪威。
在挪威，當EU ETS 開始運行時，由于其眾多經濟部門已經納入了碳稅的征稅范圍，因此一些部門（主要是油氣部門）并沒有與其他歐盟國家一樣納入ETS第一階段的覆蓋范圍。在這一階段，挪威只有10%的二氧化碳排放量（主要來自加工工業）納入了ETS。從2008年第二階段開始，挪威不再允許其需要繳納碳稅的油氣、
造紙等部門免于進入EUETS。也就是說，從2008年開始，挪威的油氣等部門既需要繳納碳稅，同時又受EU ETS規制。接著，挪威國內的
航空業在2012年也開始同時受兩個政策的規制。最新數據顯示，挪威油氣部門和國內航空部門占全國二氧化碳碳排放量的26%；只受ETS規制的制造業部門，占挪威二氧化碳排放量的22%，而只需繳納碳稅的熱電、道路
交通、漁業等部門，占挪威二氧化碳排放量的36%。
