隨著執法力度不斷加大，不法分子也在挖空心思規避處罰、逃避打擊。有的企業利用暗管、灌注等隱蔽方式違法排污；有的企業私自修改環境監測設備數據；有的企業與有資質的處置企業相互勾結，非法處置污染物；有的企業跨行政區劃異地傾倒廢物。 

李軍剛說，當前，環境違法行為呈現出隱蔽化、專業化、團伙化等特點，發現查處難度加大。從偵查打擊實踐來看，環境污染犯罪團伙化、專業化趨勢明顯。一些犯罪團伙，數十名成員分工明確，合作緊密，手段專業，發現難度高，造成危害大。

困難不僅源于不法分子越來越狡猾，還有很多客觀問題阻礙打擊效力。

李軍剛分析說，取證難、鑒定難、認定難問題依然突出。有些案件因為鑒定方法缺乏標準依據、鑒定時間長等原因，在法定時限內難以取得鑒定意見；有的地方能夠出具法定鑒定意見的機構少，無法滿足實際辦案需要；有的污染物鑒定費用或環境損害評估費用動輒數十上百萬元，公安機關辦案經費捉襟見肘。

當前，霧霾等大氣污染已成亟待治理的突出環境問題，但由于大氣污染物流動性大、稀釋速度快等原因，提取固定證據和責任認定較困難，給公安機關查處打擊增加很大難度，影響打擊震懾效果。

“公安機關辦理環境污染案件時，還受一些地方保護主義干擾?！崩钴妱偺寡?，有的地方環境污染問題的形成往往與地方政府片面追求GDP有很大關系，許多排污企業是地方招商引資來的利稅大戶，公安機關查辦這類企業的污染問題容易受到干擾和制約。