清潔發(fā)展機制在實際運行中表現(xiàn)出一些局限性。一些分散型小規(guī)模的減排項目具有減排潛力大，且更有利于國家和地方可持續(xù)發(fā)展的特點，但這些潛在項目往往分布在發(fā)展中國家的相對落后區(qū)域或者是分布在最不發(fā)達國家。這些項目如果作為單個項目，不僅受限于方法學(xué)，還受限于較高的開發(fā)成本和交易費用。為此，從2005年12月聯(lián)合國氣候變化框架公約第11次會議暨京都議定書締約方第1次會議開始，規(guī)劃類清潔發(fā)展機制項目的國際規(guī)則開始醞釀，并于2007年7月締約方第33次會議上頒布了規(guī)劃類清潔發(fā)展機制的相關(guān)實施規(guī)則。

世界銀行的碳基金體系中，2009年開始運行碳伙伴基金（CPF）專門用來支持規(guī)劃類活動，并側(cè)重支持那些尚沒有享受到情境發(fā)展機制益處的地域，尤其支持能效以及城市碳金融規(guī)劃活動。截至2013年10月23日,全球在聯(lián)合國清潔發(fā)展機制執(zhí)行理事會（EB）注冊的PCDM項目共224個。其中2009年2個，2010年3個，2011年11個，2012年195個，013年13個，中國共注冊了40個。其中中國最近的是2013年1月25日注冊成功的“河北省動物糞便管理系統(tǒng)溫室氣體減排規(guī)劃方案”該項目得到了世界銀行碳伙伴基金的支持。