首先，在免費發放配額的“祖父法”框架下，市場設立初期為鼓勵企業參與，采用的是“自下而上”確定配額數量的方法。然而，這種方法很容易產生配額發放過多，難以保證區域減排總量目標的完成，所以ZF在后期往往需要采用“自上而下”的方法對配額總量額度進行調整。由此，免費發放配額的“祖父法”事實上存在著一定程度的不確定性，交易價格也容易產生較大的波動，并不利于市場各參與者形成穩定的預期。而在拍賣發放配額的方式下，ZF能夠更好地基于整體減排目標的考慮，提供一套更為穩定的排放配額發放的
政策框架，有利于企業在穩定預期的前提下，合理安排減排行動，從而實現更低成本的減排。
其次，免費發放的“祖父法”存在著鼓勵企業高排放、打擊自主減排努力的負面效果，拍賣發放配額的方式則能較好地解決上述
問題，在鼓勵和引導社會資本流向減排技術的研發和推廣方面更具有優勢。歐盟的實踐表明，一些高排放企業通過所持有的免費配額獲取了額外的利潤，不僅導致行業內部和行業之間的競爭扭曲，也不利于低排放技術的研發和推廣。在“拍賣法”下，配額發放的方法簡單、規則清晰、目標明確，更為公平和有效率。
