（2）非營利組織
非營利組織和慈善機構對于擁有可持續發展效益的碳補償項目來說是一個天然的市場。因為購買志愿碳補償對于個人來講，實際上是承擔個人行動對氣候影響的責任，對于環境組織來說，他們進行碳補償也是對自己承諾的一種履行。而對于非營利組織來說購買碳補償只是管理信譽風險的一種方式。例如，一些國際非營利組織他們擁有大量出行預算，目的是為消除貧困和苦難，但卻可能會因為大量的航空出行所產生的碳排放而遭到批評。但是，有一些組織反對利用碳補償，并質疑其效用，他們認為碳補償只不過是一個治標的方案，而真正的問題是使用化石燃料。而且，補償的費用相當低，并不會減少人們使用航空運輸。
另外，一些組織可能沒有正式的補償政策，但是會強烈建議員工對他們自身產生的排放進行補償，他們會提供相關的信息，并鼓勵員工使用自行車或者公共交通設施。
對慈善機構特而言，他們別關心的一點是對于碳補償的投資是否與整體使命相符合。例如，發展和人道主義機構的目的和法律規定其機構的目標為“消除貧困與痛苦”，因此，其委托捐贈的用于碳補償的資金也應該直接或間接的實現這個目標。需要指出的是，氣候變化影響最大的是那些最貧窮、最弱勢群體的貧窮國家，因此，有志于消除貧困的組織應該為自己的碳排放承擔責任。而且，在低收入國家開展有實際收益的碳補償項目將會給當地帶來雙重利益，即完成發展目標和緩解氣候變化。