在ETS中，配額分配和總量設定的關系密切。按照一定方法分配的配額加總后，要與ETS總的排放上限相等。建設全國統一的ETS，要確定全國ETS的排放總量目標，并將相應的配額分配到各個納入企業。由于屬地管理的需要，還要確定各省納入ETS部分的排放總量。

因此，分析全國統一ETS下的分配方式，需要理清全國ETS排放總量、各省納入ETS部分的排放總量和納入企業配額三者之間的關系，從而提出三者的確定方式。

全國ETS排放總量的確定，可以采用“分解法”，將全國總體碳排放控制目標分解到ETS部門和非ETS部門，得到ETS總量；也可以采用“加總法”，由各省ETS覆蓋部分的排放總量加總得到全國ETS的排放總量。各省ETS覆蓋部分的排放總量的確定，可以采用“自頂向下”的方式，由中央政府或省級政府確定；也可以采用“自底向上”的方式，將按一定方法分配給企業的配額加總得到。配額分配方法，可以由中央政府確定，也可以由省級政府確定。相關政策選擇如圖1所示。